Чем похожа команда Ubuntu sudo apt-get update в Fedora?

Нет, до тех пор, пока вы не отключите сетевое соединение (или если вы это сделаете, то восстановите его автоматически, что достаточно сложно). Командам по своей сути все равно, через какой интерфейс они выдаются.

Однако возможно, что сеанс SSH будет иметь меньше привилегий, чем консольный сеанс. В этом случае могут быть вещи, которые возможно сделать через сеанс SSH в принципе, но не разрешено для конкретного сеанса SSH, или даже для всех сеансов SSH, которые могут быть открыты в конкретной конфигурации.

Вход в консоль, очевидно, дает некоторые привилегии, связанные с взаимодействием с консолью. Традиционно это означает право на взаимодействие с терминальным устройством (клавиатурой и дисплеем). Современные системы часто связывают с входом в консоль другие привилегии, например, право монтировать съемные устройства, получать доступ к другим периферийным устройствам, таким как аудиоустройства, инициировать приостановку или перезагрузку и т.д. Современные системы Linux используют для этого polkit, с ConsoleKit или systemd's logind для отслеживания того, какой пользователь имеет активную консольную сессию.

Традиционно суперпользователь (root) имеет все привилегии. Все привилегии означают все, и не имеет значения, вошел ли root в систему через SSH или через консоль. Обычно принято отключать прямой вход root через SSH, но это зависит от конфигурации системы. Большинство Unix-систем в конфигурации по умолчанию позволяют получить доступ к учетной записи root через su или sudo из сеанса SSH, но это можно отключить, например, через pam_securetty.

Современные Unix-системы могут ограничивать учетную запись root, например, с помощью SELinux. Усиленная система может разрешать сеансы root по SSH, но ограничивать их таким образом, который не применяется для входа в консоль. Опять же, это будет вопросом конфигурации, например, политики SELinux.