Как оболочка выполняет программу?

$ csplit -zsf file -n 1 ip.txt /^chr/ {*} ; paste file* | column -nt
chr10:127293562-127293909  chr11:49214073-49214804  chr11:49854587-49855127
BRUNOL4(Hs/Mm)             BRUNOL4(Hs/Mm)           A1CF(Hs/Mm)
CPEB4(Hs/Mm)               BRUNOL5(Hs/Mm)           BRUNOL4(Hs/Mm)
CUG-BP(Hs/Mm)              CPEB2(Hs/Mm)             
DAZAP1(Hs/Mm)              CPEB4(Hs/Mm)             
ENOX1(Hs/Mm)               CUG-BP(Hs/Mm)            
FMR1(Hs/Mm)                HNRNPC(Hs/Mm)            
                           HNRNPCL1(Hs/Mm)          
                           HNRNPH1(Hs/Mm)           
                           HuR(Hs/Mm)               
                           MBNL1(Hs/Mm)             
                           NOVA1(Hs/Mm)             
  • csplit , используемый для разделения файлов на основе шаблона
    • -z , параметр для удаления пустых файлов (для таких случаев, как сопоставление с шаблоном самой первой строки)
    • -s подавить вывод журнала
    • -f file -n 1 имя выходных файлов начинается с file , а суффикс из одной цифры
    • ip.txt является входным файлом, / ^ chr / - шаблон для работы с
    • {*} как можно больше разделений
  • затем вставка используется для объединения разделенных файлов по столбцам
  • столбцам -nt используется для стилизации вывода при вставке, -n предотвращает поведение по умолчанию столбца для объединения смежных разделителей и расширения GNU
11
27.08.2015, 07:39
0 ответов

Теги

Похожие вопросы