Неудаляемый каталог

RedHat 6 использует upstart в качестве системы init.

Вам нужно создать правильное определение init в /etc/init (примечание: НЕ /etc/init.d).

например (но может потребоваться отладка) /etc/init/myservice

start on runlevel [2345]
stop on runlevel [S016]

respawn
exec /code/to/program

Значение respawn заставит программу перезапуститься, если она завершится.