отправьте запрос новых функций sf.net/projects/fluxbox. то, что Вы хотите, в настоящее время блокируется этой частью кода в src/WindowState.cc:
38 bool WindowState::useBorder() const {
39 return !fullscreen && maximized != MAX_FULL && deco_mask & DECORM_BORDER;
40 }
(если максимизируется не является вертикально-единственным или горизонтально-единственным),
Или попробуйте zenity. Можно сделать все виды забавных вещей с уведомлениями, включая индикаторы выполнения (хотя они используют обычное всплывающее окно).