Используйте подстановку процесса .
В Bash
mpirun -np 16 <(ssh server cat c.x)
Синтаксис позволяет вам, по сути, преобразовать вывод команды оболочки в файл.
В Zsh
mpirun -np 16 =(ssh server cat c.x)
ssh remote "mpirun -np 16 /dev/fd/0" < c.x
Это может работать или не работать в зависимости от потребностей программы mpirun.