Почему я не могу удалить пустой каталог с именем пользователя www-data? [дубликат]

Linux - это не Windows. Между ними есть принципиальная разница.

В Linux правильная установка приложений должна соответствовать примерно этому документу. http://www.pathname.com/fhs/pub/fhs-2.3.html

Предполагается, что он разрешает совместное использование библиотек и «кода», чтобы, например, ваш музыкальный проигрыватель и проигрыватель фильмов оба могут использовать одну и ту же библиотеку для создания звуков.

Windows «может» это сделать, но часто не делает. Чаще всего исполняемые файлы в Windows упакованы вместе со своими зависимостями. В Linux упакован только исполняемый файл. Библиотеки помечены как зависимости. Такие системы, как apt, предназначены для автоматического разрешения этих зависимостей. Ваш "R" пакет, вероятно, просто плохо определен или установлен не через apt.

Так что либо используйте apt для установки пакетов, либо используйте программу установки вашего пакета для поиска и установки зависимостей.

Упаковщик Ruby отлично справляется с этим. R, по-видимому, вызывает у вас проблемы.

Вы не можете установить пакет через один менеджер пакетов и ожидать, что другой узнает о его зависимостях.