возможно, эта справка с практическими рекомендациями:
http://www.nakedmcse.com/Home/tabid/39/forumid/14/threadid/37/scope/posts/Default.aspx
Вы должны смочь выполнить сценарии жемчуга с nginx.
Я полагаю, что у Вас нет правильных полномочий на / и т.д. Это также не может быть перезаписываемо группой. Попробовать
sudo chmod g-w /etc
Это помогает?