Перезагрузитесь, и Debian должен автоматически проверить диск на наличие ошибок и исправить их.
Если этого не происходит (маловероятно) и ошибка повторяется при следующей загрузке, находясь в загрузчике GRUB, отредактируйте командную строку ядра (с помощью e) и добавьте forcefsck
в конце строки, заканчивающейся quiet