Вам нужно будет добавить параметр ядра, чтобы GRUB мог расшифровать диск и загрузить ваше ядро.
Добавьте команду ниже в параметр ядра GRUB:
cryptdevice=UUID=device-UUID:lvm root=/dev/mapper/MyVol-root
The <device-UUID> refers to the UUID of /dev/sdaX
Расшифровать, а затем загрузить, вот и все. Для получения дополнительной информации см. Arch Wiki.