Следующее сработало для меня на Linux Mint с Sony Mp3 Player и скрытыми файлами, которые я не мог удалить иначе:
sudo fdisk -l # To located usb device
Device Boot Start End Blocks Id System
/dev/sdb1 7 944127 1888242 b W95 FAT32* #Note: 32bit
sudo umount /dev/sdb1
sudo mkfs.vfat -F 32 -I /dev/sdb1 #Use 32 or 16 dependent on your version