“tar - исключать-резервные-копии” не исключают файлы с тильдой в конце
Я полагаю, что Debian будет (или может?) перезаписывают и эффективно удаляют Вашу домашнюю папку, и шифрование ее не является защитой от нее перезаписываемый.
Необходимо скопировать домашнюю папку во внешний жесткий диск, если это возможно, таким образом, можно восстановить ее позже.
Резервное копирование. Резервное копирование. Резервное копирование.
Я полагаю, что это - ошибка, которая была исправлена, в июле 2011, но вероятно еще не добралась до Вашей версии tar.
v.1.26 является текущей версией и был выпущен 19 месяцев назад (т.е. март 2011), но будет некоторая задержка между восходящим патчем и Ubuntu, выставляющей фиксацию. Это похоже, в восходящем направлении еще не выпустили это как исправление ошибки, так как последние 1,26 загрузки все еще датированы мартом 2011.