Переменная не будет расширена, когда ВНУТРИ оболочки mysql

Вы можете использовать Vim в режиме Ex:

заменить строку ALF на BRA во всех файлах в текущем каталоге?

for CHA in *
do
  ex -sc '%s/ALF/BRA/g' -cx "$CHA"
done

сделать то же самое рекурсивно для подкаталогов?

find -type f -exec ex -sc '%s/ALF/BRA/g' -cx {} ';'

заменить, только если имя файла совпадает с другой строкой ?

for CHA in *.txt
do
  ex -sc '%s/ALF/BRA/g' -cx "$CHA"
done

заменить, только если строка найдена в определенном контексте?

ex -sc 'g/DEL/s/ALF/BRA/g' -cx file

заменить, если строка находится на определенном номере строки?

ex -sc '2s/ALF/BRA/g' -cx file

заменить несколько строк одной и той же заменой

ex -sc '%s/\vALF|ECH/BRA/g' -cx file

заменить несколько строк разными заменами

ex -sc '%s/ALF/BRA/g|%s/FOX/GOL/g' -cx file