Восстановите файлы из резервной копии.
Если у вас нет резервной копии, файлы были важными и вам повезло, вы можете попробовать extundelete инструмент. Возможно, используйте другую машину для его установки и подключите диск как внешний.
Чтобы защитить себя от подобных ошибок в будущем: делайте резервные копии, тестируйте перед запуском и добавьте следующее в профиль bash:
alias cp='cp -i'
alias mv='mv -i'
Это потребует подтверждения при попытке перезаписи.
Вы можете использовать один из инструментов регулярных выражений, который поддерживает обратные ссылки, например.
sed '/\(.\)\1/d' file
grep -v '\(.\)\1' file
Измените .
на [[:alpha:]]
, если вы действительно хотите ограничить его повторяющимися буквами, а не любыми повторяющимися символами.