bash: pig: command not found

У меня тоже была эта проблема, что до сих пор не исправлено в Mendeley. Основываясь на замечательном предложении que que, я решил свою проблему с помощью emacs, но в пакетном режиме, что позволило мне обернуть решение в сценарий оболочки.

Во-первых, я создал следующий сценарий emacs lisp (назовем его bibsort.el):

( defun bibsort()
    ( bibtex-sort-buffer )
    ( save-buffer )
)

Он сортирует любой файл bibtex по имени ключа и затем сохраняет его. Вы можете вызвать сценарий в пакетном режиме из командной строки. Я пошел дальше в написании сценария оболочки, чтобы вызывать его для каждого файла bibtex, который Менделей переупорядочил (со свежими ссылками или без них), проверив код возврата из «git diff filename » (это экономит время, не запускать код Lisp без необходимости для файлов, которые не изменились).

Вот сценарий оболочки (назовем его в воображении bibsort.sh), который предполагает, что и файлы bibtex, и сценарий lisp находятся в текущем каталоге:

#!/bin/bash

bibliobasher() {

    IFS=$( echo -en "\n" )
    BIBFILES=*.bib

    for bibfile in $BIBFILES
    do
        git diff --quiet "$bibfile" 2> /dev/null
        if [ $? = 1 ]; then
            emacs --batch -l bibsort.el "$bibfile" -f bibsort
        fi
    done
}

bibliobasher

Просто запустите его (после установки прав доступа к файлам, если необходимо) перед каждым git commit:

chmod a+x bibsort.sh
./bibsort.sh
git commit ...

Он не коснется дополнительных строк, отличных от bibtex, добавленных Mendeley, и должен работать с любой установкой Unix / Linux с emacs. Он также работает на консоли GIT в Windows (которую я использую), но вам придется установить сборку emacs MINGW отдельно.

На мой взгляд, коммиты git теперь работают элегантно и экономично. Надеюсь, это поможет ...