Вопросы Теги

Использование идентификаторов для извлечения заголовков идентификаторов и добавления во второй столбец в файле B

Чтобы получить и распечатать первое вхождение каждого сообщения, попробуйте 

awk '! m[$5] {m[$5]=$0} END{for (e in m) print m[e]}'

Я сделал временные метки в вашем примере последовательными, чтобы проверить его (а также исправил последнее усеченное значение ошибки): 

$ awk '! m[$5] {m[$5]=$0} END{for (e in m) print m[e]}' tr2.log
Apr 30 16:51:27.574 application.crit: [6104]:TR#14. Transaction send can not be sent. Error Code: 704
Apr 30 16:51:31.574 application.crit: [6104]:TR#238. Transaction send can not be sent. Error Code: 704

С благодарностью @terdon

0
08.04.2019, 21:54
1 ответ

Команда:

c=`awk '{print NR}' file2| sort -nr | sed -n '1p'`;for ((i=1;i<=$c;i++)); do j=`awk -v i="$i" 'NR==i{$1=$2="";print $0}' file1`; awk -v i="$i" -v j="$j" 'NR == i{$3=$2;$2=j;print $0}' file2; done| sed "s/complete genome.txt/complete genome/g"

выход 

c=`awk '{print NR}' file2| sort -nr | sed -n '1p'`;for ((i=1;i<=$c;i++)); do j=`awk -v i="$i" 'NR==i{$1=$2="";print $0}' file1`; awk -v i="$i" -v j="$j" 'NR == i{$3=$2;$2=j;print $0}' file2; done| sed "s/complete genome.txt/complete genome/g"
NC_001348_71671_71760_KY215944.1   Herpesviridae Human herpesvirus 3, complete genome GCGCGGCTGGTGATGCAATGCGTGACCAGCTACTGGCGCAACTCGCGCTGCGCCGCCTTTGTGAACAGCTTCCCCATGGTGATGTACATC
NC_001350_89668_89757_HQ221963.1   Herpesviridae Saimiriine herpesvirus 2 complete genome CTTTCAGGATTTTCTGGCAGTTTTGCTGTCAAGAATGACATGATCTGGTGATGCCATATCTCAATATACAGCGCAGTGCTCACTGGTCTG
NC_001491_126502_126591_AF480884.1   Herpesviridae Equid herpesvirus 1, complete genome AACGTGTCGGTGCGCACGGCCGTCAGGGCGAAGCCCGGGTGGATGTGGGCCTTGGTCTGCAGCACCAGCGACACCGGCGAGATCTTGTAC
NC_001798_97563_97652_AY714813.1   Herpesviridae Human herpesvirus 2 strain HG52, complete genome CGCAGGTGCCCGAAGACGTCGCAGACGGCCGCCCGCAGGGCCATGCACTGCATGGAGCCCGTGGTGCCGCCCGGCCCCCGGTCCAGGTGC
NC_001806_196955_197044_FJ483970.2   Herpesviridae Human herpesvirus 1 strain 17, complete genome TCATCGATCTCAGTCTGTCGGCCGCTCCACGGCTCTGACTGGACTTTCCAAAGTACATACTGCAGTCAGAGCTGTCGAGCGGTTAACAGA
0
28.01.2020, 03:51

Теги

Похожие вопросы