Как предотвратить закрытие ST после выполнения приведенной команды С -Е?

С помощью zsh :

mylist=(${(f)"$(

Он считывает строки из filelist в массиве, а затем использует ] квалификаторы glob / e строка для выбора / выбора только имен файлов, отсутствующих в массиве: . выбирает только обычные файлы (добавьте D , если ваш список содержит точечные файлы), а отрицательное ^ e_'expression '_ далее выбирает только те, для которых выражение возвращает false, т. Е. Если их имя ( $ REPLY ) не является элементом массива .
Если результат вас устраивает, замените print -rl на rm , чтобы удалить файлы:

rm -- *(.^e_'(($mylist[(Ie)$REPLY]))'_)

Чтобы выбрать и удалить файлы рекурсивно, используйте глобус * / ** с модификатором глобуса $ {REPLY: t} :

rm -- */**(.^e_'(($mylist[(Ie)${REPLY:t}]))'_)