Как работает переадресация между аргументами

Оболочка анализирует строку команды -и устанавливает перенаправление. В этом случае он видит > FileC, устанавливает соответствующее перенаправление и удаляет эти термины из команды :, так что в конечном итоге выполняется

command FileA FileB

commandникогда не видит часть > FileC.

См. Что такое операторы управления и перенаправления оболочки? для получения подробной информации о перенаправлении в целом.