Нет никаких проблем с установкой модуля пакета Python с помощью корневого входа в систему или некоторого другого пользователя кроме корня.
Так или иначе можно удалить пакет Python с помощью зернышка и easy_install как ниже.
#pip uninstall packagename
#easy_install -m PackageName