Добавление других серверов имен в ] /etc/resolv.conf
устраняет проблему. Раньше это выглядело так:
user@debian82:~$ nano /etc/resolv.conf
nameserver 10.0.0.138
Теперь это выглядит так:
user@debian82:~$ nano /etc/resolv.conf
nameserver 10.0.0.138
nameserver <ISP's dns name server>
nameserver 8.8.8.8 <(Google's)>
И соединение возобновлено:
PING google.com (194.90.196.110) 56(84) bytes of data.
64 bytes from 194.90.196.110: icmp_seq=1 ttl=59 time=14.5 ms
64 bytes from 194.90.196.110: icmp_seq=2 ttl=59 time=15.9 ms
64 bytes from 194.90.196.110: icmp_seq=3 ttl=59 time=15.3 ms
64 bytes from 194.90.196.110: icmp_seq=4 ttl=59 time=14.0 ms
64 bytes from 194.90.196.110: icmp_seq=5 ttl=59 time=15.3 ms
^C
--- google.com ping statistics ---
5 packets transmitted, 5 received, 0% packet loss, time 5882ms
rtt min/avg/max/mdev = 14.030/15.048/15.930/0.669 ms
awk
awk -F'/' '$NF ~ /^HI\./{ print $NF }' infile
, чтобы удалить суффикс .md5
, вы можете сделать:
awk -F'(/|.md5)' '$(NF-1) ~ /^HI\./{ print $(NF-1) }' infile
в awk
, $0
относится ко всей строке/записи, а $1
, $2
, $3
,... относятся к первой, второй, третьей,... соответственно ; и $NF
относится к последнему полю, и, соответственно, $(NF-1)
является предпоследним полем.
оператор тильда ~
в awk обрабатывает оператор правой -руки как (расширенное )регулярное -сопоставление выражения с левым -операндом руки как строкуstring ~ /regular-expression/
sed
:sed 's:.*/\([^/]*\)\.md5$:\1: ; /^HI\./!d' infile
этот /\([^/]*\)\.md5
соответствует последней косой черте, за которой следует что угодно, но не косая черта, оканчивающаяся на .md5
. Мы берем\([^/]*\)
(все, что находится между последней косой чертой и .md5
, как групповое совпадение, и печатаем только это в замещающей части с обратной -ссылкой \1
.
это /^HI\./!d
удаляет строки, которые не начинаются с HI.
из результата предыдущей команды sed
.
мы использовали другой разделитель sed
:
, так как у нас есть специальный символ /
на входе.
Попробуйте это,
awk -F '/' '$NF ~ /^HI/ {print substr($NF, 1, length($NF)-4)}' file.txt
HI
.md5
Выход
HI.2613.007.Custom_0022.ED9_SD2A27-1_180_R1.fastq.gz
HI.2613.007.Custom_0022.ED9_SD2A27-1_180_R2.fastq.gz
HI.2613.007.Custom_0021.ED4_KS1A29-7_338_R1.fastq.gz
HI.2613.007.Custom_0021.ED4_KS1A29-7_338_R2.fastq.gz
HI.2613.007.Index_18.ED17_MO1A26-7_353_R1.fastq.gz
HI.2613.007.Index_18.ED17_MO1A26-7_353_R2.fastq.gz
HI.2613.007.Index_14.ED14_IA2A35-2_310_R1.fastq.gz