Не удается установить python3 на Ubuntu 18,04
При запуске Debian 8.2 у меня была та же проблема, я решил ее, добавив vboxsf в /etc/modules (из этого ответа askubuntu).
Mutter — оконный менеджер композитинга. Скорее всего, он сохраняет буфер окна, даже когда de -иконизирован. Это полезно для функций переключения окна -. Например, «обзор» GNOME3 показывает полное содержимое всех окон, включая иконные. Metacity не занимается композитингом, поэтому не использует закадровые буферы.
То, что вы описываете, может быть ошибкой в Mutter и/или вашей клиентской программе X11. То есть вы должны предположить, что это не проблема конфигурации.
Ошибка может быть в вашем коде или в Java/Swing. Справедливости ради, если бы вы вручную определяли, иконизировано ли ваше окно, а затем избегали запроса на перерисовку, я подозреваю, что вы, возможно, уже поняли, что проблема :-).
Размышляя о GNOME3, я могу предположить, что он не был -хорошо протестирован, потому что стандартный GNOME3 не имеет кнопки «Свернуть» в заголовке окна.
Существует работа -, которую вы можете попробовать в своем коде. Я предполагаю, что это довольно очевидно :-). т.е. подождите, пока окно не будет -иконизировано, а затем запросите перерисовку.