Как следует из названия, у вас есть только двоичные файлы, что означает, что у вас нет исходного кода программы, у вас есть скомпилированная программа.
В мире windows обычно так все и работает, в Linux, поскольку большинство программ с открытым кодом, у вас есть код, и вы можете сами проверить его, если хотите изучить или изменить его, или если у вас паранойя по поводу того, что кто-то вставил шпионское ПО/бэкдор/что угодно в эту программу. Вы можете скомпилировать ее для себя, когда будете довольны, и получите ВАШИ двоичные файлы.
Некоторые компании, которые не хотят, чтобы их программы были открытыми, предоставляют только двоичные файлы, которые вы можете выполнить для установки или запуска их программ/драйверов/чего угодно (например, модули видеодрайверов, предоставляемые Nvidia или ATI, являются двоичными файлами)
Поскольку двоичные файлы - это скомпилированные программы, вы можете иметь двоичный файл, который может быть самой программой, и запустив его, вы запустите программу, или вы можете иметь двоичную установку, что означает, что у вас будет двоичный файл, который сделает установку программы (другой двоичный файл) в вашей системе.