Вариант 1: https://msdn.microsoft.com/en-us/library/windows/hardware/ff542202%28v=vs.85%29.aspx
Сначала установите windows. Добавьте linux в качестве одного из вариантов запуска.
Вариант 2: Установите сначала windows, когда вы установите linux на другой раздел, установите grub на "boot from partition" вместо mbr.