Не знаете, как использовать шаблон Zabbix для MySQL (800+ элементов)

Похоже, вы хотите && , а не || - || является логическим или , git будет запущен только в случае сбоя cd .

Замените:

cd "$D" || git remote -v >> "$HERE/vim-plug-remotes.txt";

на (хотя точка с запятой не нужна):

cd "$D" && git remote -v >> "$HERE/vim-plug-remotes.txt";