Какое число от 1 до 64 является номером сигнала отладки?

Если ваш первый файл достаточно мал, чтобы поместиться в памяти, вы можете сделать это в Perl:

perl -e 'open($f1,"file1"); while(<$f1>){chomp; $k{$_}++}
         while(<>){ /(.+?\s+.+?)\s/; print if defined($k{$1})' file2

Это должно быть достаточно быстро, но ему все равно нужно прочитать весь файл2.