Как перебирать динамически изменяющийся список файлов - Ubuntu bash

He aquí una idea para ti. Aunque no ha sido probado.

La idea es separar los archivos y directorios recién descomprimidos para cada archivo fuente único en su propia carpeta temporal. Esto se repite recursivamente, y cuando la recurrencia regresa desde las profundidades, los archivos y directorios se mueven a su destino adecuado y se elimina el directorio temporal.

function vacatetmp () {
    echo "Vacating TMP folder ${1}...."
    # You need a prefix for the new auxiliary temporary folders.
    prefix=SomeGoodPrefix
    for i in "$1"/*; do
        if [ -f "$i" ]; then
            # From your explanation:
            # "Look up the mime type of "$i" and unzip the files into "$1"."
            # Now, before you mix the new files and dirs with the old ones,
            # unzip them to a special new directory with the prefix and the file name
            # so that they're not mixed with the files and directories already present in "$1".
            mkdir "$1"/"${prefix}""$i" &&
            # How do you pass the target directory to "caseit"?
            # However you do, pass it the temporary folder.
            caseit "$i" "$1"/"${prefix}""$i" &&
            # Now the new unzipped files and folders are in "$1"/"${prefix}""$i", so
            # vacatetmp the auxiliary prefixed directory: 
            vacatetmp "$1"/"${prefix}""$i" &&
            # and after you've finished with vacatetmp-ing that directory,
            # move the contents of it to "$1".           
            mv "$1"/"${prefix}""$i"/* "$1" &&
            # And finally remove the prefixed directory.
            rmdir "$1"/"${prefix}""$1"
            # This file is done. Recursively.
        elif [ -d "$i" ]; then
            vacatetmp "$i"
        fi
    done
}

Avísame si me equivoqué en alguna parte. No ha sido probado, como he advertido antes.

Iterar sobre los archivos primero, abrirlos y luego iterar sobre los directorios.

for i in "$1/*"; do [[ -f "$i" ]] && caseit "$i"; done; 
for i in "$1/*"; do [[ -d "$i" ]] && vacatetmp "$i"; done

Sería más completo llamar también a vacatetmp()desde dentro de caseit(), al final. Pero dudo que sea necesario, y conduciría a un código menos mantenible.