Как принудительно закрыть новый терминал из скрипта, когда Настройки профиля -> Команда-> Когда команды завершаются: -> Удерживайте терминал открытым

top не показывает все процессы (по крайней мере, не ту версию, которую я использую). Обычно она показывает только самые активные процессы - столько, сколько поместится в окне.

Я не знаком с FreeBSD - разве демон cron не назван crond?

Демоны устранения неполадок обычно означают

1) Проверьте syslog - также проверьте настройку syslog.
2) Прочитайте man-страницу демона и перезапустите ее с включенной функцией отладки.