На последней Ubuntu необходимо сделать это как это, создать /etc/init/bukkit.conf
(безотносительно .conf),
description "Some java server"
author "Moi "
start on runlevel [2345] # change start / stop level if needed
stop on runlevel [016]
pre-start script
echo "script is abort to start"
end script
exec /path/to/script param1 param2
post-start script
echo "script is started" # if you needed any post-start hack
end script
Вы пытаетесь запустить x86-64 программное обеспечение на i686 платформе. Это не будет работать. Получите i686 версию вместо этого.