1
ответ

Как проанализировать определенный идентификатор из файла FASTA

У меня есть файл в формате FASTA, имя которого следует после символа «>», за которым следует вторая строка с последовательностью. Я хотел бы отфильтровать refseqID из первой строки имени ()и удалить плавающее значение
30.11.2021
1
ответ

pr усекает вывод

У меня есть три текстовых файла, и я хочу объединить их в один текстовый файл на своем компьютере с Linux. Входные файлы :1 _val.txt 0x0000000000060b7c02555b80 0x0000000000060b7c026c6580 0x0000000000060b7c0285ff80 2 _знач
30.11.2021
1
ответ

преобразовать и заменить только значение EPOCH в файле

У меня есть ввод, как показано ниже, который имеет эпоху и число в некоторых 2-м, 3-м столбцах в случайном порядке. Я пытаюсь преобразовать даты эпохи с помощью встроенного awk -в функцию strftime (), и он заменяет значения, не входящие в значение эпохи
25.11.2021
1
ответ

Избирательное извлечение из шаблонного вхождения (удаленных повторяющихся строк )с использованием awk или sed

Файл имеет шаблон строки, в котором строка, не содержащая чисел, встречается в файле дважды. Энергия начальная, от -до -последняя, ​​окончательная = -87057.8200168321 -87208.7223900015 -87208.7197287879 Начальная энергия, следующая от -до -последняя, ​​ко
24.11.2021
1
ответ

Фильтрация одного очень большого CSV-файла на основе значений из другого CSV-файла

Я обрабатываю некоторые файлы CSV, которые не помещаются в ОЗУ. 2 файла CSV имеют следующую структуру :первый.csv я бы название отметка времени сериал ул гггг -мм -дд чч :мм :сс второй.csv я бы название Дата сериал ул гггг -мм
16.11.2021
1
ответ

регулярное выражение игнорирование кавычек

В моем файле есть следующая строка, и я хочу извлечь слово после -с, т.е. вчера без кавычек :-t -w -g london -s 'вчера' -e 'вчера' -f 100000" Требуемый результат вчерашний день Что я пробовал Первая попытка :grep -oP ' (?<=\ -s
10.11.2021
1
ответ

Хотите, чтобы скрипт bash получил txt-файл со всеми возможными комбинациями

У меня есть следующие символы, цифры и специальные символы :012345789 !@ #$% АБВГДЕЖЗИЙКЛМНОПРСТУФХЦЧШЩЫЭЮЯ АБВГДЕЖЗИЙКЛМНОПРСТУФХЦЧШЩЫЭЮЯ Мне нужен скрипт bash, который создает txt-файл, содержащий все возможные 8-значные комбинации выше, например :АК@05
09.11.2021
1
ответ

найти/обнаружить группы имен файлов

В fs у меня есть файлы типа :ПРЕФИКС _ИМЯ ГРУППЫ _ДРУГИЕ ИМЯ [.txt|. *] например :A _ABC _A.txt A _ABC _B.txt A _ABC _C.txt A _XYZ _A.txt A _XYZ _B.txt A _XYZ _C.txt Для некоторых дальнейших задач я хочу получить имена групп. $ #команда, которую я ищу рез
05.11.2021
1
ответ

Как распечатать, если есть совпадение, и оставить, если нет с помощью awk

У меня есть файл результатов A.tsv (separator = \t ):БК01 2551 99 БК03 2547 95 БК04 2578 99 БК05 2547 97 И файл с образцом информации B.tsv (separator = \t ):BC01 BC04 BC02 BC03 BC05 И хочу добавить в А.цв
02.11.2021
1
ответ

Как разобрать файл и записать в отдельные столбцы

Я пытаюсь проанализировать вывод Antismash, чтобы подсчитать количество BGC. Я нашел скрипты, которые есть у людей с python, о которых я ничего не знаю, поэтому я пытаюсь понять это, используя скрипт bash
01.11.2021
1
ответ

Могу ли я публиковать -размеры вкладок столбцов формата, чтобы интервалы были наименьшим общим знаменателем в Linux?

Я могу использовать stat для создания вывода ls, который показывает оба формата информации о разрешениях, что может быть удобно :stat --printf="%A\t%a\t%h\t%U\t%G\t%s\t%.19y\t%n\n".. *drwxr -xr -x 755 4 бобышки 4096 2021 -10 -29 22 :49
01.11.2021
1
ответ

Коды клавиш xinput не совпадают с таблицей xmodmap

Существует ли таблица, в которой коды клавиш из команды xinput test -xi2 --root 3 сопоставляются с keysyms? Я пробовал xmodmap -pke, который нашел в ArchWiki, но они не совпадают. Как вообще X взаимодействует с клавиатурой
30.10.2021
1
ответ

Объединение двух текстовых файлов с помощью AWK

У меня нет большого опыта работы с awk, поэтому я изо всех сил пытаюсь решить одну проблему. У меня есть два файла с именами file1.txt и file2.txt. Файл1.txt :20 101 1 2 3 4 20 102 5 6 7 8 20 108 3 3 3 3 Файл2.txt
29.10.2021
1
ответ

Как преобразовать файл Unix с фиксированной шириной в файл с разделителями вертикальной черты с использованием порядкового номера столбца и длины поля

Я хочу преобразовать файл фиксированной ширины в файл с разделителями вертикальной черты в UNIX, используя порядковую позицию столбца и длину поля. Вход выглядит так, 00100000003779U20210203 00200000004238U20210203 Требуемый вывод
27.10.2021
1
ответ

Как заменить/удалить новую строку (\n )?

У меня есть доступ только к busybox 1.27.2. В настоящее время я обрабатываю словарь, содержащий более полумиллиона слов и более 6000 страниц (, который был извлечен из PDF-файла с помощью ghostscript и преобразован в обычный текст ). Находится в файле.txt
25.10.2021
1
ответ

Переменная не принимается в awk при передаче из файла

Я читаю строку файла -по -строке. Каждая строка выглядит так :xxyu :JHYU _IOPI Каждая строка передается в awk, как показано ниже. Я хочу напечатать предыдущую строку соответствующего шаблона; Я могу добиться этого с помощью grep и хочу знать, где я допуст
24.10.2021
1
ответ

Сравнение со значением CSV-файла

У меня есть CSV-файл, и мне нужно сравнить значение в 4-м столбце 2-й строки со строкой. Образец CSV-файла :Кол1, Кол2, Кол3, Кол4 Val1, Val2, Val3, ValNeeded Я использую приведенный ниже код для выполнения этого, varcsv= `sed '2q;d' файл.csv | вырезать -
22.10.2021
1
ответ

Организация файлов по содержащимся в них датам

В настоящее время я пытаюсь написать сценарий, который организует список файлов в подкаталоги по их дате. Даты содержатся в первой строке каждого файла в формате ГГГГ -ММ -ДД
21.10.2021
1
ответ

Заменить ближайшую следующую строку/слово после определенного шаблона

В моем файле есть такой шаблон, как этот file.py ARG. Я хочу выполнить поиск по шаблону file.py и заменить ARG новым значением (, не удаляя двойную кавычку в конце )во всех совпадениях. Входной файл выглядит так :"СПК" :"
20.10.2021
1
ответ

Заменить значение столбца в CSV-файле из другого файла

У меня есть CSV-файл с 85 полями. Я хочу заменить значения столбца номер 52 данными из другого файла. Этот второй файл содержит только 1 столбец и имеет такое же количество записей, как и в 1-м файле. например, файл data.CSV (1-й файл csv )0,126,,2,0
20.10.2021
1
ответ

выполните замену с помощью awk и sed из шаблона файла в файл

У меня есть этот файл _1, в котором есть 3 столбца, разделенные табуляцией или пробелом. Хххг _2345 _4567 _33678 Хххг _2345 _4567 _33678 97,0376 Hhhg _2345 _4567 _33679 Шина _56576 _567 _899 70,4077 Хххг _2345 _4567 _33680 Джу _679 __89090 79
19.10.2021
1
ответ

Как игнорировать начальные пробелы в sed при замене?

Я хочу игнорировать начальные пробелы в файле при поиске и замене шаблона. Окончательный вывод не должен содержать пробелов. Мне нужно сопоставить всю строку и заменить на нужную строку
19.10.2021
1
ответ

groff ms indentfirst и frenchspacing

Я набираю черновики своих статей с помощью пакета макросов ms, но в моем языке (испанском )принято делать отступы во всех абзацах и оставлять пробелы после точки
15.10.2021
1
ответ

Выбор уникальных значений в определенном столбце

Я попытался использовать следующее :awk '{print $1}' ваш файл _| сортировать | уникальный Однако на выходе получается не так, как ожидалось. Вот примеры того, как выглядят значения в интересующем меня столбце :«Код заболевания, не являющегося -раковым, са
13.10.2021
1
ответ

Использование awk для вычисления среднего значения каждой строки с разным количеством столбцов

Можно ли использовать awk для вычисления среднего значения каждой строки (с разными столбцами в каждой строке ). У меня есть файл, подобный следующему, первый столбец — это имена
09.10.2021
1
ответ

проанализировать список файлов в каталоге и сохранить в новую папку

Здравствуйте, у меня есть следующий код для i в *.dssp ; делать gawk 'BEGIN{ FIELDWIDTHS = "5 5 1 1 4 1 *"} $4 == "A" {s=s$6} END {print s}' | tr "[HGI]" "H" | tr "[BE]" "E" | tr "[TS ' ']"
05.10.2021
1
ответ

Регулярное выражение для соответствия одному экземпляру символа

У меня есть эта штука, которую я поддерживаю на работе, и она использует довольно загадочный DSL. И инструментарий для этого не велик. Чтобы справиться с плохим инструментарием, я написал несколько скриптов, чтобы попытаться найти некоторые проблемы с код
03.10.2021
1
ответ

grep для извлечения уникальных фраз с заглавной буквы

В приведенном ниже фрагменте выводится список всех слов, написанных с заглавной буквы, из исходного текста :grep -o '[^ ] *[[ :верхний :]][^ ] *' book _text.txt > С заглавными буквами _words.txt Теперь я хотел бы извлечь и подсчитать количество вхождений
01.10.2021
1
ответ

Pregunta sobre el uso de sed, filtrado de datos

Aquí hay un archivo de texto de muestra :almacenar :xxx Eliminar :xxx Vence :sábado, 30 de octubre de 02021 13 :01 :57 +0100 almacenar :xxx Eliminar :xxx Vence :sábado, 30 de octubre de 02021 13 :01 :57 +0100 almacenar :abc almacenar :sdf Vence :sábado, 3
28.09.2021
1
ответ

Удалить CR+LF из ячейки в файле CSV

Данные в столбце b содержат символы CR+LF, которых там быть не должно. Похоже на это :а, б, в тест1, тест2 тест2 бис, тест3 Но это должно выглядеть так :а, б, в тест1, тест2 тест2 бис, тест3 Как я могу удалить это с помощью sed или awk?
28.09.2021