apt
вызываются всякий раз, когда производится обновление системы (например, с помощью Ubuntu's Update Manager).
Любые пакеты, загруженные таким образом, сохраняются до тех пор, пока вы явно не очистите их, как это делается при вызове apt-get clean
.
Если место на диске занято в премиум-классе, а ваш менеджер обновлений запускается автоматически каждый день, например, в 8:00, вы можете настроить работу cron на 8:30, чтобы выполнить очистку. Единственное наказание заключается в том, что если вы удалите пакет, а затем захотите переустановить его, то его нужно будет загрузить еще раз.