Что делает gzip < my file.gzip >?

Я решал аналогичную проблему, но раньше у меня возникали проблемы при попытке использовать сценарии, приведенные в одном из ответов (как WSL, так и Mac )...

Я продолжил поиски и нашел очень простое решение. :Это функция getfastaиз набора bedtools!

https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/tools/getfasta.html

0
27.08.2020, 21:11
2 ответа

Вы пробовали запустить gzip --help? Это должно ответить на ваш вопрос об использовании.

Выход изgzip --help:

Usage: gzip [OPTION]... [FILE]...
Compress or uncompress FILEs (by default, compress FILES in-place).

Mandatory arguments to long options are mandatory for short options too.

  -c, --stdout      write on standard output, keep original files unchanged
  -d, --decompress  decompress
  -f, --force       force overwrite of output file and compress links
  -h, --help        give this help
  -k, --keep        keep (don't delete) input files
  -l, --list        list compressed file contents
  -L, --license     display software license
  -n, --no-name     do not save or restore the original name and time stamp
  -N, --name        save or restore the original name and time stamp
  -q, --quiet       suppress all warnings
  -r, --recursive   operate recursively on directories
  -S, --suffix=SUF  use suffix SUF on compressed files
  -t, --test        test compressed file integrity
  -v, --verbose     verbose mode
  -V, --version     display version number
  -1, --fast        compress faster
  -9, --best        compress better
  --rsyncable       Make rsync-friendly archive

With no FILE, or when FILE is -, read standard input.

Report bugs to <bug-gzip@gnu.org>.
0
18.03.2021, 23:09

<и >являются оболочками. < file.txtозначает рассматривать file.txtкак вход, а > file.txtозначает рассматривать file.txtкак выход. Команда может быть примерно такой:

% gzip < input.gz > output.txt

Это позволит взять сжатый gzip (сжатый )входной файл input.gzи записать несжатую версию как output.txt. Это может быть не текстовый файл.

Надеюсь, это поможет.

2
18.03.2021, 23:09

Теги

Похожие вопросы