Где вариант Linux (beta )на моем Acer Chromebook 15?

Поскольку вы новичок, мы будем создавать это решение поэтапно.

A find, чтобы найти все ваши файлы из/imaging/

find /imaging/ -iname *.mgz

Добавьте -exec \;для выполнения команды (мы начнем сecho)один раз для каждого найденного файла (имя файла представлено как{})

find /imaging/ -iname *.mgz -exec echo {} \;

Используйте sh -c, чтобы разрешить более сложные сценарии в -execне только простые команды,переход в целевой каталог и имя файла, найденное как $1 и $2

find /imaging/ -iname *.mgz -exec sh -c 'echo $1 $2' sh {} "/path/to/store/patient/files/" \; 2>/dev/null

наконец, составить новое имя файла из идентификатора пациента в 3-м каталоге и скопировать из старого местоположения в новое, используя новый идентификатор пациента в качестве имени файла

find /imaging/ -iname *.mgz -exec sh -c 'p=${1#/*/*/}; p=${p%%/*}; echo cp $1 $2$p.mgz' sh {} "/path/to/store/patient/files/" \; 2>/dev/null

Примечание. Я оставил команду cpпросто как echo, чтобы вы могли запустить ее и убедиться в правильности вывода перед фиксацией. Если все в порядке, просто удалите echoи запустите его.