Это должно работать:
rename 's/\(.*\)|\[.*\]//g' *
В противном случае без использования команды rename
(OT):
for file in folder*; do
mv "$file" "${file/\(Done\)/}"
done
Из файла README.md вы должны запустить это как
т. е. вашему док-контейнеру требуется NET _ADMIN на хосте.