Меню Putty > Change Settings...
>Category :
Window
> Translation
> Remote Character Set
= UTF -8
Если на вашем компьютере с Windows установлен Python, вы можете попробовать это:
http://pypi.python.org/pypi/ssh4py
Если у вас нет Python, проще установить putty Scp
https://it.cornell.edu/managed-servers/transfer-files-using-putty