Как пользователь, сказанный в комментариях, wmctrl
не был затронут с октября 2005. Его очень возможное, что известное работало в то время и было с тех пор сделано поврежденным из-за пакетов, переезжающих его.
Вот wmctrl
журнал изменений
xdotool search --name xyz set_desktop_for_window 4294967295