В любом случае вам понадобится root-доступ для установки и настройки любого программного обеспечения на вашем сервере.
После этого вы можете работать как обычный пользователь и получать доступ к своим файлам.
Посмотрите здесь , например, как установить и настроить LAMP на сервере CentOS.